פגוניה קטנת-פרחים היא צמח רב-שנתי מסועף, עדין אך קוצני מאוד, שרוע, קוטרו 10–20 ס"מ, קירח, מסתעף, ענפיו מרווחים. הגבעול מרובע בחתך, זיגזגי, פרקיו קצרים. הצמח רותמי: רוב השנה הוא ללא עלים, גבעוליו ירוקים ומטמיעים, והוא נראה כסבכה קוצנית ירוקה. העלים נגדיים, תלתניים (לעתים העלים העליונים פשוטים), טעמם חריף. העלעלים אזמליים מוארכים, אורכם 5–10 מ"מ, ובקצה כל עלעל יש חוד יבש. בבסיס כל עלה מזדקרים זוג עלי-לואי קוצניים ארוכים.
פגוניה קטנת-פרחים פורחת באביב, במרס–אפריל. הפרח סגול, פרוש לרווחה, קטן (קוטרו פחות מ-8 מ"מ), דליל: רוחב עלה הכותרת קטן בהרבה מהרווח בין עלי הכותרת). 5 עלי הגביע שאירים ונפוצים יחד עם הפרי, 5 עלי כותרת, 10 אבקנים צהובים. הצוף גלוי, והפרח מואבק על-ידי מגוון רחב של חרקים שוחרי-צוף. השחלה מחומשת, הופכת לפרי עם 5 שקעים לאורכו, קוטרו פחות מ-4 מ"מ.
פגוניה קטנת-פרחים גדלה בערוצים חמים ובמדרונות-אבנים במדבר קיצוני. היא שכיחה בדרום הנגב והבקעה, נעשית נדירה עם העליה צפונה.
תפוצתו העולמית של המין משתרעת במדבריות צפון אפריקה ודרום-מערב אסיה.
בסוג 40 מינים, בארץ 9, כולם מדבריים.
כתב: מייק לבנה